机器学习实战—— Chap03.Decision Tree

电玩女神 2023-06-13 11:18 11阅读 0赞

"""
    用字典存储决策树结构：
    {'有自己的房子':{0:{'有工作':{0:'no', 1:'yes'}}, 1:'yes'}}
    年龄：0代表青年，1代表中年，2代表老年
    有工作：0代表否，1代表是
    有自己的房子：0代表否，1代表是
    信贷情况：0代表一般，1代表好，2代表非常好
    类别（是否给贷款）：no代表否，yes代表是
    pickle包可以将决策树保存下来，方便下次直接调用
    """
    from matplotlib.font_manager import FontProperties
    import matplotlib.pyplot as plt
    from math import log
    import operator
    import pickle
    
    """
    Desc:
        创建测试数据集
        
    Parameters:
        None
        
    Returns:
        dataSet - 数据集
        labels - 分类属性
    """
    def createDataSet():
        # 数据集
        dataSet = [[0, 0, 0, 0, 'no'],
                   [0, 0, 0, 1, 'no'],
                   [0, 1, 0, 1, 'yes'],
                   [0, 1, 1, 0, 'yes'],
                   [0, 0, 0, 0, 'no'],
                   [1, 0, 0, 0, 'no'],
                   [1, 0, 0, 1, 'no'],
                   [1, 1, 1, 1, 'yes'],
                   [1, 0, 1, 2, 'yes'],
                   [1, 0, 1, 2, 'yes'],
                   [2, 0, 1, 2, 'yes'],
                   [2, 0, 1, 1, 'yes'],
                   [2, 1, 0, 1, 'yes'],
                   [2, 1, 0, 2, 'yes'],
                   [2, 0, 0, 0, 'no']]
        # 分类属性
        labels = ['年龄', '有工作', '有自己的房子', '信贷情况']
        # 返回数据集和分类属性
        return dataSet, labels
    
    
    """
    Desc:
        计算给定数据集的经验熵（香农熵）
            Ent（D） = -SUM（kp*Log2（kp））
            
    Parameters:
        dataSet - 数据集
        
    Returns:
        shannonEnt - 经验熵（香农熵）
    """
    def calcShannonEnt(dataSet):
        # 返回数据集的行数
        numEntires = len(dataSet)
        # 保存每个标签（Label）出现次数的“字典”
        labelCounts = {
        }
        # 对每组特征向量进行统计
        for featVec in dataSet:
            # 提取标签（Label）信息
            currentLabel = featVec[-1]
            # 如果标签（Label）没有放入统计次数的字典，添加进去
            if currentLabel not in labelCounts.keys():
                # 创建一个新的键值对，键为currentLabel值为0
                labelCounts[currentLabel] = 0
            # Label计数
            labelCounts[currentLabel] += 1
        # 经验熵（香农熵）
        shannonEnt = 0.0
        # 计算香农熵
        for key in labelCounts:
            # 选择该标签（Label）的概率
            prob = float(labelCounts[key]) / numEntires
            # 利用公式计算
            shannonEnt -= prob*log(prob, 2)
        # 返回经验熵（香农熵）
        return shannonEnt
    
    """
    Desc:
        按照给定特征划分数据集
        
    Parameters:
        dataSet - 待划分的数据集
        axis - 划分数据集的特征
        values - 需要返回的特征的值
        
    Returns:
        None
    """
    def splitDataSet(dataSet, axis, value):
        # 创建返回的数据集列表
        retDataSet = []
        # 遍历数据集的每一行
        for featVec in dataSet:
            if featVec[axis] == value:
                # 去掉axis特征
                reducedFeatVec = featVec[:axis]
                # 将符合条件的添加到返回的数据集
                # extend() 函数用于在列表末尾一次性追加另一个序列中的多个值（用新列表扩展原来的列表）。
                reducedFeatVec.extend(featVec[axis+1:])
                # 列表中嵌套列表
                retDataSet.append(reducedFeatVec) 
        # 返回划分后的数据集
        return retDataSet
        
    
    """
    Desc:
        选择最优特征
            Gain(D,g) = Ent(D) - SUM(|Dv|/|D|)*Ent(Dv)
            
    Parameters:
        dataSet - 数据集
        
    Returns:
        bestFeature - 信息增益最大的（最优）特征的索引值
    """
    def chooseBestFeatureToSplit(dataSet):
        # 特征数量
        numFeatures = len(dataSet[0]) - 1
        # 计算数据集的香农熵
        baseEntropy = calcShannonEnt(dataSet)
        # 信息增益
        bestInfoGain = 0.0
        # 最优特征的索引值
        bestFeature = -1
        # 遍历所有特征
        for i in range(numFeatures):
            # 获取dataSet的第i个所有特征存在featList这个列表中（列表生成式）
            featList = [example[i] for example in dataSet]
            # 创建set集合{}，元素不可重复，重复的元素均被删掉
            # 从列表中创建集合是python语言得到列表中唯一元素值得最快方法
            uniqueVals = set(featList)
            # 经验条件熵
            newEntropy = 0.0
            # 计算信息增益
            for value in uniqueVals:
                # subDataSet划分后的子集
                subDataSet = splitDataSet(dataSet, i, value)
                # 计算子集的概率
                prob = len(subDataSet) / float(len(dataSet))
                # 根据公式计算经验条件熵
                newEntropy += prob * calcShannonEnt(subDataSet)
            # 信息增益
            infoGain = baseEntropy - newEntropy
            # 打印每个特征的信息增益
            print("第%d个特征的增益为%.3f" % (i, infoGain))
            # 计算信息增益
            if(infoGain > bestInfoGain):
                # 更新信息增益，找到最大的信息增益
                bestInfoGain = infoGain
                # 记录信息增益最大的特征的索引值
                bestFeature = i
        # 返回信息增益最大的特征的索引值
        return bestFeature
    
    
    """
    Desc:
        统计classList中出现次数最多的元素（类标签）
            服务于递归第两个终止条件
    Parameters:
        classList - 类标签列表
        
    Returns:
        sortedClassCount[0][0] - 出现次数最多的元素（类标签）
    """   
    def majorityCnt(classList):
        classCount = {
        }
        # 统计classList中每个元素出现的次数
        for vote in classList:
            if vote not in classCount.keys():
                classCount[vote] = 0
            classCount[vote] += 1
        # 根据字典的值降序排序
        # operator.itemgetter(1)获取对象的第1列的值
        sortedClassCount = sorted(classCount.items(), key = operator.itemgetter(1), reverse = True)
        # 返回classList中出现次数最多的元素
        return sortedClassCount[0][0]
    
    
    """
    Desc:
        创建决策树（ID3算法）
            递归有两个终止条件：
            1、所有的类标签完全相同，直接返回类标签
            2、用完所有标签但是得不到唯一类别的分组，即特征不够用，挑选出现数量最多的类别作为返回
    Parameters:
        dataSet - 训练数据集
        labels - 分类属性标签
        featLabels - 存储选择的最优特征标签
        
    Returns:
        myTree - 决策树
    """
    def createTree(dataSet, labels, featLabels):
        # 取分类标签（是否放贷：yes or no）
        classList = [example[-1] for example in dataSet]
        # 如果类别完全相同则停止继续划分
        if classList.count(classList[0]) == len(classList):
            return classList[0]
        # 遍历完所有特征时返回出现次数最多的类标签
        if len(dataSet[0]) == 1:
            return majorityCnt(classList)
        # 选择最优特征
        bestFeat = chooseBestFeatureToSplit(dataSet)
        # 最优特征的标签
        bestFeatLabel = labels[bestFeat]
        featLabels.append(bestFeatLabel)
        # 根据最优特征的标签生成树
        myTree = {
        bestFeatLabel:{
        }}
        # 删除已经使用的特征标签
        del(labels[bestFeat])
        # 得到训练集中所有最优解特征的属性值
        featValues = [example[bestFeat] for example in dataSet]
        # 去掉重复的属性值
        uniqueVals = set(featValues)
        # 遍历特征，创建决策树
        for value in uniqueVals:
            myTree[bestFeatLabel][value] = createTree(splitDataSet(dataSet, bestFeat, value), labels, featLabels)
        return myTree
    
    
    """
    Desc:
        获取决策树叶子结点的数目
        
    Parameters:
        myTree - 决策树
        
    Returns:
        numLeafs - 决策树的叶子结点的数目
    """ 
    def getNumLeafs(myTree):
        # 初始化叶子
        numLeafs = 0
        # python3中myTree.keys()返回的是dict_keys,不是list,所以不能用
        # myTree.keys()[0]的方法获取结点属性，可以使用list(myTree.keys())[0]
        # next() 返回迭代器的下一个项目 next(iterator[, default])
        firstStr = next(iter(myTree))
        # 获取下一组字典
        secondDict = myTree[firstStr]
        for key in secondDict.keys():
            # 测试该结点是否为字典，如果不是字典，代表此节点为叶子结点
            if type(secondDict[key]).__name__ == 'dict':
                numLeafs += getNumLeafs(secondDict[key])
            else:
                numLeafs += 1
        return numLeafs
    
    
    """
    Desc:
        获取决策树的层数
        
    Parameters:
        myTree - 决策树
        
    Returns:
        maxDepth - 决策树的层数
    """   
    def getTreeDepth(myTree):
        # 初始化决策树深度
        maxDepth = 0
        # python3中myTree.keys()返回的是dict_keys,不是list,所以不能用
        # myTree.keys()[0]的方法获取结点属性，可以使用list(myTree.keys())[0]
        # next() 返回迭代器的下一个项目 next(iterator[, default])
        firstStr = next(iter(myTree))
        # 获取下一个字典
        secondDict = myTree[firstStr]
        for key in secondDict.keys():
            # 测试该结点是否为字典，如果不是字典，代表此节点为叶子结点
            if type(secondDict[key]).__name__ == 'dict':
                thisDepth = 1 + getTreeDepth(secondDict[key])
            else:
                thisDepth = 1
            # 更新最深层数
            if thisDepth > maxDepth:
                maxDepth = thisDepth
        # 返回决策树的层数
        return maxDepth
    
    
    """
    Desc:
        绘制结点
        
    Parameters:
        nodeTxt - 结点名
        centerPt - 文本位置
        parentPt - 标注的箭头位置
        nodeType - 结点格式
        
    Returns:
        None
    """  
    def plotNode(nodeTxt, centerPt, parentPt, nodeType):
        # 定义箭头格式
        arrow_args = dict(arrowstyle="<-")
        # 设置中文字体
        font = FontProperties(fname=r"C:\Windows\Fonts\simsun.ttc", size=14)
        # 绘制结点createPlot.ax1创建绘图区
        # annotate是关于一个数据点的文本
        # nodeTxt为要显示的文本，centerPt为文本的中心点，箭头所在的点，parentPt为指向文本的点
        createPlot.ax1.annotate(nodeTxt, xy=parentPt, xycoords='axes fraction', 
                                xytext=centerPt, textcoords='axes fraction',
                                va='center', ha='center', bbox=nodeType, 
                                arrowprops=arrow_args, FontProperties=font)
    
    
    """
    Desc:
        标注有向边属性值
        
    Parameters:
        cntrPt、parentPt - 用于计算标注位置
        txtString - 标注内容
        
    Returns:
        None
    """ 
    def plotMidText(cntrPt, parentPt, txtString):
        # 计算标注位置（箭头起始位置的中点处）
        xMid = (parentPt[0]-cntrPt[0])/2.0 + cntrPt[0]
        yMid = (parentPt[1]-cntrPt[1])/2.0 + cntrPt[1]
        createPlot.ax1.text(xMid, yMid, txtString, va="center", ha="center", rotation=30)
    
    
    """
    Desc:
        绘制决策树
        
    Parameters:
        myTree - 决策树（字典）
        parentPt - 标注的内容
        nodeTxt - 结点名
        
    Returns:
        None
    """ 
    def plotTree(myTree, parentPt, nodeTxt):
        # 设置结点格式boxstyle为文本框的类型，sawtooth是锯齿形，fc是边框线粗细
        decisionNode = dict(boxstyle="sawtooth", fc="0.8")
        # 设置叶结点格式
        leafNode = dict(boxstyle="round4", fc="0.8")
        # 获取决策树叶结点数目，决定了树的宽度
        numLeafs = getNumLeafs(myTree)
        # 获取决策树层数
        depth = getTreeDepth(myTree)
        # 下个字典
        firstStr = next(iter(myTree))
        # 中心位置
        cntrPt = (plotTree.xoff + (1.0 + float(numLeafs)) / 2.0 / plotTree.totalW, plotTree.yoff)
        # 标注有向边属性值
        plotMidText(cntrPt, parentPt, nodeTxt)
        # 绘制结点
        plotNode(firstStr, cntrPt, parentPt, decisionNode)
        # 下一个字典，也就是继续绘制结点
        secondDict = myTree[firstStr]
        # y偏移
        plotTree.yoff = plotTree.yoff - 1.0 / plotTree.totalD
        for key in secondDict.keys():
            # 测试该结点是否为字典，如果不是字典，代表此结点为叶子结点
            if type(secondDict[key]).__name__ == 'dict':
                # 不是叶结点，递归调用继续绘制
                plotTree(secondDict[key], cntrPt, str(key))
            # 如果是叶结点，绘制叶结点，并标注有向边属性值
            else:
                plotTree.xoff = plotTree.xoff + 1.0 / plotTree.totalW
                plotNode(secondDict[key], (plotTree.xoff, plotTree.yoff), cntrPt, leafNode)
                plotMidText((plotTree.xoff, plotTree.yoff), cntrPt, str(key))
        plotTree.yoff = plotTree.yoff + 1.0 / plotTree.totalD
        
    
    """
    Desc:
        创建绘图面板
        
    Parameters:
        inTree - 决策树（字典）
        
    Returns:
        None
    """ 
    def createPlot(inTree):
        # 创建fig
        fig = plt.figure(1, facecolor="white")
        # 清空fig
        fig.clf()
        axprops = dict(xticks=[], yticks=[])
        # 去掉x、y轴
        createPlot.ax1 = plt.subplot(111, frameon=False, **axprops)
        # 获取决策树叶结点数目
        plotTree.totalW = float(getNumLeafs(inTree))
        # 获取决策树层数
        plotTree.totalD = float(getTreeDepth(inTree))
        # x偏移
        plotTree.xoff = -0.5 / plotTree.totalW
        plotTree.yoff = 1.0
        # 绘制决策树
        plotTree(inTree, (0.5, 1.0), '')
        # 显示绘制结果
        plt.show()
        
       
    """
    Desc:
        使用决策树分类
        
    Parameters:
        inputTree - 已经生成的决策树
        featLabels - 存储选择的最优特征标签
        testVec - 测试数据列表，顺序对应最优特征标签
        
    Returns:
        classLabel - 分类结果
    """ 
    def classify(inputTree, featLabels, testVec):
        # 获取决策树结点
        firstStr = next(iter(inputTree))
        # 下一个字典
        secondDict = inputTree[firstStr]
        featIndex = featLabels.index(firstStr)
        for key in secondDict.keys():
            if testVec[featIndex] == key:
                if type(secondDict[key]).__name__ == 'dict':
                    classLabel = classify(secondDict[key], featLabels, testVec)
                else:
                    classLabel = secondDict[key]
        return classLabel
    
    
    """
    Desc:
        存储决策树
        
    Parameters:
        inputTree - 已经生成的决策树
        filename - 决策树的存储文件名
        
    Returns:
        None
    """   
    def storeTree(inputTree, filename):
        with open(filename, 'wb') as fw:
            pickle.dump(inputTree, fw)
    
    
    """
    Desc:
        读取决策树
        
    Parameters:
        filename - 决策树的存储文件名
        
    Returns:
        pickle.load(fr) - 决策树字典
    """ 
    def grabTree(filename):
        fr = open(filename, 'rb')
        return pickle.load(fr)
    
    
    """
    Desc:
        main函数
        
    Parameters:
        None
        
    Returns:
        None
    """   
    def main():
        dataSet, features = createDataSet()
        featLabels = []
        myTree = createTree(dataSet, features, featLabels)
        # storeTree(myTree, 'classifierStorage.txt')
        # myTree = grabTree('classifierStorage.txt')
        # print(myTree)
        # 测试数据
        testVec = [0, 1, 1, 1]
        result = classify(myTree, featLabels, testVec)
        if result == 'yes':
            print('放贷')
        if result == 'no':
            print('不放贷')
        print(myTree)
        createPlot(myTree)
        # print(dataSet)
        # print(calcShannonEnt(dataSet))
        print("最优特征索引值:" + str(chooseBestFeatureToSplit(dataSet)))
    
    if __name__ == '__main__':
        main()

'''
    第0个特征的增益为0.083
    第1个特征的增益为0.324
    第2个特征的增益为0.420
    第3个特征的增益为0.363
    第0个特征的增益为0.252
    第1个特征的增益为0.918
    第2个特征的增益为0.474
    放贷
    {'有自己的房子': {0: {'有工作': {0: 'no', 1: 'yes'}}, 1: 'yes'}}
    <Figure size 640x480 with 1 Axes>
    第0个特征的增益为0.083
    第1个特征的增益为0.324
    第2个特征的增益为0.420
    第3个特征的增益为0.363
    最优特征索引值:2
    '''

"""
    数据的Labels依次是age、prescript、astigmatic、tearRate、class
    年龄、症状、是否散光、眼泪数量、分类标签
    """
    import os
    os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'
    from sklearn.preprocessing import LabelEncoder, OneHotEncoder
    import pandas as pd
    import numpy as np
    import pydotplus
    from sklearn.externals.six import StringIO
    from sklearn import tree
    
    if __name__ == '__main__':
        # 加载文件
        with open('lenses.txt') as fr:
            # 处理文件，去掉每行两头的空白符，以\t分隔每个数据
            lenses = [inst.strip().split('\t') for inst in fr.readlines()]
        # 提取每组数据的类别，保存在列表里
        lenses_targt = []
        for each in lenses:
            # 存储Label到lenses_targt中
            lenses_targt.append([each[-1]])
        # 特征标签
        lensesLabels = ['age', 'prescript', 'astigmatic', 'tearRate']
        # 保存lenses数据的临时列表
        lenses_list = []
        # 保存lenses数据的字典，用于生成pandas
        lenses_dict = {
        }
        # 提取信息，生成字典
        for each_label in lensesLabels:
            for each in lenses:
                # index方法用于从列表中找出某个值第一个匹配项的索引位置
                lenses_list.append(each[lensesLabels.index(each_label)])
            lenses_dict[each_label] = lenses_list
            lenses_list = []
        # 打印字典信息
        # print(lenses_dict)
        # 生成pandas.DataFrame用于对象的创建
        lenses_pd = pd.DataFrame(lenses_dict)
        # 打印数据
        # print(lenses_pd)
        # 创建LabelEncoder对象
        le = LabelEncoder()
        # 为每一列序列化
        for col in lenses_pd.columns:
            # fit_transform()干了两件事：fit找到数据转换规则，并将数据标准化
            # transform()直接把转换规则拿来用,需要先进行fit
            # transform函数是一定可以替换为fit_transform函数的，fit_transform函数不能替换为transform函数
            lenses_pd[col] = le.fit_transform(lenses_pd[col])
        # 打印归一化的结果
        # print(lenses_pd)
        # 创建DecisionTreeClassifier()类
        clf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion='entropy', max_depth=4)
        # 使用数据构造决策树
        # fit(X,y):Build a decision tree classifier from the training set(X,y)
        # 所有的sklearn的API必须先fit
        clf = clf.fit(lenses_pd.values.tolist(), lenses_targt)
        dot_data = StringIO()
        # 绘制决策树
        tree.export_graphviz(clf, out_file=dot_data, feature_names=lenses_pd.keys(),
                             class_names=clf.classes_, filled=True, rounded=True, 
                             special_characters=True)
        graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
        # 保存绘制好的决策树，以PDF的形式存储。
        graph.write_pdf("tree.pdf")
        #预测
        print(clf.predict([[1,1,1,0]]))

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