记一次 ClickHouse 性能测试

小鱼儿 2023-09-28 20:24 14阅读 0赞

#### 前言 ####

在工作场景中，我们会采集工厂设备数据用于智能控制，数据的存储用了 InfluxDB，随着数据规模越来越大，InfluxDB 的性能越来越差，故考虑引入 ClickHouse 分担 InfluxDB 大数据分析的压力，再加上我们业务上也用到了 MySQL ，所以本文就来对比下 MySQL、InfluxDB、ClickHouse 在千万数据量下的写入耗时、聚合查询耗时、磁盘占用等各方面性能指标。

#### 结论先行 ####

最终的结论是，直接使用 ClickHouse 官网提供的 6600w 数据集来做对比测试，在 MySQL、InfluxDB、ClickHouse 同样分配 4c16g 资源的情况下，ClickHouse 无论是导入速度、磁盘占用、查询性能都完全碾压 MySQL 和 InfluxDB，具体对比指标如以下表格：

<table> 
 <thead> 
  <tr> 
   <th></th> 
   <th>MySQL</th> 
   <th>InfluxDB</th> 
   <th>ClickHouse</th> 
  </tr> 
 </thead> 
 <tbody> 
  <tr> 
   <td>导入耗时</td> 
   <td>大概耗时70分钟</td> 
   <td>大概耗时35分钟</td> 
   <td>75秒</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>磁盘空间</td> 
   <td>12.35 G</td> 
   <td>5.9 G</td> 
   <td>2.66 G</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>全表count</td> 
   <td>24366 ms</td> 
   <td>11674 ms</td> 
   <td>100 ms</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>全表max/min</td> 
   <td>27023 ms</td> 
   <td>26829 ms</td> 
   <td>186 ms</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>全表平均值</td> 
   <td>24841 ms</td> 
   <td>12043 ms</td> 
   <td>123 ms</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>全表方差</td> 
   <td>24600 ms</td> 
   <td>OOM</td> 
   <td>113 ms</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>复杂查询1</td> 
   <td>30260 ms</td> 
   <td>OOM</td> 
   <td>385 ms</td> 
  </tr> 
  <tr> 
   <td>复杂查询2</td> 
   <td>470 ms</td> 
   <td>200 ms</td> 
   <td>8 ms</td> 
  </tr> 
 </tbody> 
</table>

为了确保测试结果相对准确，以上每条sql起码执行5次，然后取中间值。其中 InfluxDB 表现比想象中的要差，甚至还不如 MySQL，可能是数据样本和测试用例不太适合 InfluxDB 场景导致的，如果大家对测试结果有疑问，可以 `git clone [https://github.com/stone0090/clickhouse-test.git](https://github.com/stone0090/clickhouse-test.git)`项目，完整验证以上对比全过程。

#### 数据库简介 ####

MySQL

MySQL 是一个关系型数据库管理系统，由瑞典 MySQL AB 公司开发，属于 Oracle 旗下产品，是最流行的关系型数据库管理系统之一。它所使用的 SQL 语言是用于访问数据库的最常用标准化语言。它采用了双授权政策，分为社区版和商业版，由于其体积小、速度快、总体拥有成本低，尤其是开放源码这一特点，一般中小型和大型网站的开发都选择 MySQL 作为网站数据库。《高性能MySQL》一书中开篇明义讲到的最核心的一句话是“MySQL并不完美，但是却足够灵活”，它是架构中的万金油，庞杂非单一的项目中总会有它的用武之地。

InfluxDB

InfluxDB 是一个由 InfluxData 公司开发的开源时序型数据库，专注于海量时序数据的高性能读、高性能写、高效存储与实时分析，在 DB-Engines Ranking 时序型数据库排行榜上位列榜首，广泛应用于DevOps监控、IoT监控、实时分析等场景。 传统数据库通常记录数据的当前值，时序型数据库则记录所有的历史数据，在处理当前时序数据时又要不断接收新的时序数据，同时时序数据的查询也总是以时间为基础查询条件，并专注于解决以下海量数据场景的问题：

*  时序数据的写入：如何支持千万级/秒数据的写入；
 *  时序数据的读取：如何支持千万级/秒数据的聚合和查询；
 *  成本敏感：海量数据存储带来的是成本问题，如何更低成本地存储这些数据。

ClickHouse

ClickHouse 是 Yandex（俄罗斯最大的搜索引擎）开源的一个用于实时数据分析的基于列存储的数据库，其处理数据的速度比传统方法快 100-1000 倍。ClickHouse 的性能超过了目前市场上可比的面向列的 DBMS，每秒钟每台服务器每秒处理数亿至十亿多行和数十千兆字节的数据。它是一个用于联机分析（OLAP）的列式数据库管理系统（DBMS），简单介绍一下 OLTP 和 OLAP。

*  OLTP：是传统的关系型数据库，主要操作增删改查，强调事务一致性，比如银行系统、电商系统。
 *  OLAP：是仓库型数据库，主要是读取数据，做复杂数据分析，侧重技术决策支持，提供直观简单的结果。

那 ClickHouse OLAP 适用场景有：1）读多于写；2）大宽表，读大量行但是少量列，结果集较小；3）数据批量写入，且数据不更新或少更新；4）无需事务，数据一致性要求低；5）灵活多变，不适合预先建模。

#### 环境准备 ####

在阿里云买一台 16c64g 的服务器，操作系统 centos 7.8，使用 sealos 一键安装 k8s，使用 helm 一键安装 mysql（5.7）、influxdb（1.8）、clickhouse（22.3） ，每个应用各分配 4c16g 的资源。

# 下载 sealos
    $ wget https://github.com/labring/sealos/releases/download/v4.0.0/sealos_4.0.0_linux_amd64.tar.gz \
    && tar zxvf sealos_4.0.0_linux_amd64.tar.gz sealos && chmod +x sealos && mv sealos /usr/bin
    
    # 初始化一个单节点 Kubernetes
    $ sealos run labring/kubernetes:v1.24.0 labring/calico:v3.22.1 --masters [xxx.xxx.xxx.xxx] -p [your-ecs-password]
    
    # 去掉 master 的污点，允许安装应用到 master 和 control-plane
    $ kubectl taint nodes --all node-role.kubernetes.io/master-
    $ kubectl taint nodes --all node-role.kubernetes.io/control-plane-
    
    # 获取 mysql、influxdb、clickhouse 一键安装 Helm-Charts
    $ wget https://github.com/stone0090/clickhouse-test/archive/refs/tags/v1.0.0.tar.gz
    $ tar -zxvf v1.0.0.tar.gz
    
    # 安装 Kubernetes 包管理工具 Helm，以及 mysql、influxdb、clickhouse 3大数据库
    $ sealos run labring/helm:v3.8.2
    $ helm install mysql clickhouse-test-1.0.0/helm-charts/mysql/
    $ helm install influxdb clickhouse-test-1.0.0/helm-charts/influxdb/
    $ helm install clickhouse clickhouse-test-1.0.0/helm-charts/clickhouse/
    复制代码

#### 数据导入 ####

直接使用 ClickHouse 官方提供的测试数据 [clickhouse.com/docs/zh/get…][clickhouse.com_docs_zh_get]，此数据集中的数据是从完整的 OpenSky 数据集中派生和清理而来的，以说明 COVID-19 新冠肺炎大流行期间空中交通的发展情况。它涵盖了自2019年1月1日以来该网络超过2500名成员看到的所有航班，总数据量有6600w。

# 在服务器 /home/flightlist 目录执行以下命令，该目录会被挂载到 mysql-pod、influxdb-pod、clickhouse-pod 内
    $ wget -O- https://zenodo.org/record/5092942 | grep -oP 'https://zenodo.org/record/5092942/files/flightlist_\d+_\d+\.csv\.gz' | xargs wget
    
    # 批量解压 flightlist.gz 数据
    $ for file in flightlist_*.csv.gz; do gzip -d "$file"; done
    
    # 将 csv 处理成 influxdb 导入所需的 txt 格式（此过程大概耗时1小时）
    $ python clickhouse-test-1.0.0/influxdb_csv2txt.py
    复制代码

MySQL

# 进入 mysql pod
    $ kubectl exec -it [influxdb-podname] -- bash
    
    # 连上 mysql 建库、建表
    $ mysql -uroot -p123456
    $ use test;
    $ CREATE TABLE `opensky` (`callsign` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`number` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`icao24` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`registration` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`typecode` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`origin` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`destination` varchar(255) COLLATE utf8mb4_unicode_ci DEFAULT NULL,`firstseen` datetime DEFAULT NULL,`lastseen` datetime DEFAULT NULL,`day` datetime DEFAULT NULL,`latitude_1` double DEFAULT NULL,`longitude_1` double DEFAULT NULL,`altitude_1` double DEFAULT NULL,`latitude_2` double DEFAULT NULL,`longitude_2` double DEFAULT NULL,`altitude_2` double DEFAULT NULL,KEY `idx_callsign` (`callsign`),KEY `idx_origin` (`origin`),KEY `idx_destination` (`destination`)) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci;
    
    # 导入数据（大概耗时70分钟）
    $ load data local infile 'flightlist_20190101_20190131.csv' into table opensky character set utf8mb4 fields terminated by ',' lines terminated by '\n' ignore 1 lines;
    # 省略其他29条导入命令：load data local infile 'flightlist_*_*.csv' into table opensky character set utf8mb4 fields terminated by ',' lines terminated by '\n' ignore 1 lines;
    
    # 检查数据是否导入成功
    $ select count(*) from test.opensky;
    复制代码

InfluxDB

# 进入 influxdb pod
    $ kubectl exec -it [influxdb-podname] -- bash
    
    # 导入数据（大概耗时30分钟）
    $ influx -username 'admin' -password 'admin123456' -import -path=/tmp/flightlist/flightlist_20190101_20190131.txt -precision=ns;
    # 省略其他29条导入命令：influx -username 'admin' -password 'admin123456' -import -path=/tmp/flightlist/flightlist_*_*.txt -precision=ns;
    
    # 检查数据是否导入成功
    $ influx -username 'admin' -password 'admin123456'
    $ select count(latitude_1) from test.autogen.opensky;
    复制代码

ClickHouse

# 进入 clickhouse pod
    $ kubectl exec -it [clickhouse-podname] -- bash
    
    # 连上 clickhouse 建库、建表
    $ clickhouse-client
    $ create database test;
    $ use test;
    $ CREATE TABLE opensky(callsign String,number String,icao24 String,registration String,typecode String,origin String,destination String,firstseen DateTime,lastseen DateTime,day DateTime,latitude_1 Float64,longitude_1 Float64,altitude_1 Float64,latitude_2 Float64,longitude_2 Float64,altitude_2 Float64) ENGINE = MergeTree ORDER BY (origin, destination, callsign);
    $ exit
    
    # 导入数据（大概耗时75秒）
    $ cd /tmp/flightlist
    $ for file in flightlist_*.csv; do cat "$file" | clickhouse-client --date_time_input_format best_effort --query "INSERT INTO test.opensky FORMAT CSVWithNames"; done
    
    # 检查数据是否导入成功
    $ clickhouse-client
    $ SELECT count() FROM test.opensky;
    复制代码

#### 测试场景 ####

MySQL

$ mysql -uroot -p123456
    $ use test;
    -- 开启性能分析
    set profiling = 1;
    -- 查询磁盘空间
    select table_rows as `总行数`, (data_length + index_length)/1024/1024/1024 as `磁盘占用(G)` from information_schema.`TABLES` where table_name = 'opensky';
    -- 全表count
    select count(latitude_1) from opensky;
    -- 全表max/min
    select max(longitude_1),min(altitude_1) from opensky;
    -- 全表平均值
    select avg(latitude_2) from opensky;
    -- 全表方差
    select var_pop(longitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询1：全表多个字段聚合查询
    select count(latitude_1),max(longitude_1),min(altitude_1),avg(latitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询2：从莫斯科三个主要机场起飞的航班数量
    SELECT origin, count(1) AS c FROM opensky WHERE origin IN ('UUEE', 'UUDD', 'UUWW') GROUP BY origin;
    -- 输出分析结果
    show profiles;
    复制代码

InfluxDB

$ influx -username 'admin' -password 'admin123456'
    $ use test;
    -- 耗时统计，queryReqDurationNs 是累计查询时间，2次任务的时间相减就是耗时
    select queryReq,queryReqDurationNs/1000/1000,queryRespBytes from _internal."monitor".httpd order by time desc limit 10;
    -- 查询磁盘空间
    select sum(diskBytes) / 1024 / 1024 /1024 from _internal."monitor"."shard" where time > now() - 10s group by "database";
    -- 全表count
    select count(latitude_1) from opensky;
    -- 全表max/min
    select max(longitude_1),min(altitude_1) from opensky;
    -- 全表平均值
    select mean(latitude_2) from opensky;
    -- 全表方差
    select stddev(longitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询1：全表多个字段聚合查询
    select count(latitude_1),max(longitude_1),min(altitude_1),mean(latitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询2：从莫斯科三个主要机场起飞的航班数量
    SELECT count(latitude_1) AS c FROM opensky WHERE origin =~/^UUEE|UUDD|UUWW$/ GROUP BY origin;
    复制代码

ClickHouse

$ clickhouse-client
    $ use test;
    -- 耗时统计
    select event_time_microseconds,query_duration_ms,read_rows,result_rows,memory_usage,query from system.query_log where query like '%opensky%' and query_duration_ms <> 0 and query not like '%event_time_microseconds%' order by event_time_microseconds desc limit 5;
    -- 查询磁盘空间
    SELECT formatReadableSize(total_bytes) FROM system.tables WHERE name = 'opensky';
    -- 全表count
    select count(latitude_1) from opensky;
    -- 全表max/min
    select max(longitude_1),min(altitude_1) from opensky;
    -- 全表平均值
    select avg(latitude_2) from opensky;
    -- 全表方差
    select var_pop(longitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询1：全表多个字段聚合查询
    select count(latitude_1),max(longitude_1),min(altitude_1),avg(latitude_2) from opensky;
    -- 复杂查询2：从莫斯科三个主要机场起飞的航班数量
    SELECT origin, count() AS c FROM opensky WHERE origin IN ('UUEE', 'UUDD', 'UUWW') GROUP BY origin;
    复制代码

#### ClickHouse 为什么快 ####

1、列式存储

数据是按列存储，数据即是索引；查询只访问涉及的列，降低系统I/O；每一列都由一个线程来处理，高效利用CPU资源；还为向量化执行做好了铺垫。

2、数据压缩

数据压缩的本质是按照一定的步长对数据进行匹配扫描，当发现重复数据的时候就进行编码转换。 因为是列式存储，所以数据特征很相似，所以数据中的重复项多，则压缩率越高，则数据体量越小，则磁盘I/O压力越小，则网络中传输越快。

3、向量化执行引擎

SIMD（Single Instruction Multiple Data）即单条指令操作多条数据，它是通过数据并行以提高性能的一种方式，可以简单理解为在寄存器层面对程序中的数据做并行处理，Clickhouse 在能够提升计算效率的地方大量使用了 SIMD，通过使用 SIMD，基本上能带来几倍的性能提升。

4、多线程和分布式

分布式领域存在一条定律，计算移动比数据移动更加划算，这也是其核心所在，将数据的计算直接发放到数据所在的服务器，多机并行处理，再把最终的结果汇集在一起；另外 ClickHouse 也通过线程级别并行的方式为效率进一步提速，极致去利用服务器的资源。

5、多样的表引擎

MergeTree 存储结构对写入的数据做排序然后进行有序存储，有序存储主要有两大优势：

*  列存文件在按块做压缩时，排序键中的列值是连续或者重复的，使得列存块的数据可以获得极致的压缩比；
 *  存储有序本身可以加速查询的索引结构，根据排序键中列的等值条件或者 rang 条件，我们可以快速找到目标所在的近似位置区间，并且这种索引结构是不会产生额外的存储开销。

MergeTree 是 ClickHouse 表引擎中最核心的引擎，其他引擎均以 MergeTree 引擎为基础，并在数据合并过程中实现了不同的特性，从而构成了 MergeTree 表引擎家族。

#### ClickHouse 的优缺点 ####

优点：极致的查询分析性能，较低的存储成本，高吞吐的数据写入，多样化的表引擎，完备的 DBMS 功能；  
缺点：不支持事务，不支持真正的删除/更新，分布式能力较弱；不支持高并发，官方建议 QPS 为100；非标准的 SQL，join 的实现比较特殊，且性能不好；频繁小批量数据操作会影响查询性能；  
目前还没有一个 OLAP 引擎能够满足各种场景的需求，其本质原因是，没有一个系统能同时在查询效率、时效性、可维护性三个方面做到完美，只能说 ClickHouse 是为了极致查询性能做了一些取舍。  
ClickHouse 优缺点都很明显，是否采用还是要取决于和实际业务场景的契合度，适合自己的架构才是最好架构。

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[clickhouse.com_docs_zh_get]: https://link.juejin.cn?target=https%3A%2F%2Fclickhouse.com%2Fdocs%2Fzh%2Fgetting-started%2Fexample-datasets%2Fopensky
[3b41f28b7e2647fca64c8ed32cf547ca.jpeg]: https://img-blog.csdnimg.cn/3b41f28b7e2647fca64c8ed32cf547ca.jpeg