graphpad prism横坐标怎么设置不显示数值_Graphpad Prism能不能画九象限图？

旧城等待， 2022-12-31 09:27 207阅读 0赞

原标题：Graphpad Prism能不能画九象限图？

我在上周一文介绍了如何使用Prism绘制火山图，在发现了可以将点的颜色与分组数据建立映射之后，我想Prism肯定也能画九象限图。于是，这里我再尝试一下绘制九象限图。

数据准备

首先，按照一文的方法，在Excel中将数据整理成下图这样的格式。ns表示两个组学都差异不显著的点，1379表示1、3、7、9象限的点，其他依此类推。

本文的范例数据可以点 阅读原文，亦可复制链接地址前往OmicShare论坛查看下载。

下载链接：

https://www.omicshare.com/forum/thread-5323-1-1.html

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打开软件后，通过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角，新建工程文件。在弹出的向导窗口选择表格类型为XY，X、Y数据的设置如下图。

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然后，除去gene id这一列，将其他6列数据粘贴到Prism的表格中，如下。

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图表调整

单击左侧导航栏中Graphs菜单下的Data 1，即可看到初始绘制结果，见下图。

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接着双击横坐标轴，将X轴的刻度范围都设置为\[-7,7\]，并在-1、1处添加辅助线，如下图，Y轴也做相同处理；点右侧的Details下的“…”按钮，可对辅助线的样式进行自由调整。在Frame and Origin选项卡下将Shape由默认的Wide改为Square(方形)，还可修改坐标轴的“包围”方式。

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再将Y轴的标题改为Ribo\_Log2FC，调整坐标轴后的初始结果如下：

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接着双击“散点”，先选择Change All data sets，然后将shape改为实心的圆，Size改为1。

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再将ns设为灰色，1379、28、46、5这4个分组的散点分别改为不同的颜色，如下。

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同时在DataSets on Graph选项下，改变各个“点”的图层顺序，如下图，这里选中ns组，点Bottom按钮，将灰色的点置于底层。

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最后，框选图例，按Delete键删掉。最终的效果如下：

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如果喜欢点大一点，也可以将点的Size调大一点，如下：

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图表导出

通过FileExport Graph 导出所需格式的图片，如下图，前5种是矢量图格式，无需设置dpi。最后，建议通过FileSave保存工程文件，方便反复调整。

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最后你可能会问：不同象限的数据是怎么筛选出来的呢？其实我这里用到的只是Excel的高级筛选，在我的下一篇文章会做介绍。

如果你觉得自己画比较难，其实在之前的《四象限图不错，但我们用更好的九象限图》一文中介绍过使用OmicShare的小工具轻松绘制九象限图，不需要合并两个组学的表达量表格，也不需数据筛选，非常简单，如下图。

![Image 1][]

当然，你还可使用这个工具输出的各个象限的数据，手工绘制更个性化的九象限图。今天的内容就到这里啦~

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