python创建一个新的txt文件-如何在python中编辑文本文件并创建一个新的文本文件？...

旧城等待， 2022-11-21 14:18 61阅读 0赞

我有这样的文本文件：>ENST00000511961.1|ENSG00000013561.13|OTTHUMG00000129660.5|OTTHUMT00000370661.3|RNF14-003|RNF14|278

MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLSPTQLSALCKHLDNLWEEHRGSVVLFAWMQFLKEETLAYLNIVSPFELKIGSQKKVQRRTAQASPNTELDFGGAAGSDVDQEEIVDERAVQDVESLSNLIQEILDFDQAQQIKCFNSKLFLCSICFCEKLGSECMYFLECRHVYCKACLKDYFEIQIRDGQVQCLNCPEPKCPSVATPGQ

>ENST00000506822.1|ENSG00000013561.13|OTTHUMG00000129660.5|OTTHUMT00000370662.1|RNF14-004|GAPDH|132

MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLSPTQLSALCKHLDNLWEEHRGSVVLFAWMQFLKE

>ENST00000513019.1|ENSG00000013561.13|OTTHUMG00000129660.5|OTTHUMT00000370663.1|RNF14-005|ACTB|99

MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLS

>ENST00000356143.1|ENSG00000013561.13|OTTHUMG00000129660.5|-|RNF14-202|HELLE|474

MSSEDREAQEDELLALASIYDGDEFRKAESVQGGETRIYLDLPQNFKIFVSGNSNECLQNSGFEYTICFLPPLVLNFELPPDYPSSSPPSFTLSGKWLSPTQLSALCKHLDNLWEEHRGSVVLFAWMQFLKEETLAYLNIVSPFELKIGSQKKVQRRTAQASPNTELDFGGAAGSDVDQEEIVDERAVQDVESLSNLIQEILDFDQAQQIKCFNSKLFLCSICFCEKLGSECMYFLECRHVYCKACLKDYFEIQIRDGQVQCLNCPEPKCPSVATPGQVKELVEAELFARYDRLLLQSSLDLMADVVYCPRPCCQLPVMQEPGCTMGICSSCNFAFCTLCRLTYHGVSPCKVTAEKLMDLRNEYLQADEANKRLLDQRYGKRVIQKAL

像这个：from itertools import groupby

with open('infile.txt') as f:

groups = groupby(f, key=lambda x: not x.startswith(">"))

d = \{\}

for k,v in groups:

if not k:

key, val = list(v)\[0\].rstrip(), "".join(map(str.rstrip,next(groups)\[1\],""))

d\[key\] = val

k = d.keys()

res = \[el\[5:\] for s in k for el in s.split("|")\]

但它返回行中的所有元素开头 ">".

你知道如何解决它吗？

这里预计输出：\["RNF14", "GAPDH", "ACTB", "HELLE"\]

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