如何检测两组数据是否同分布？

妖狐艹你老母 2022-09-14 00:23 101阅读 0赞

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Datawhale干货

**作者：刘洋，中科院大学，Datawhale成员**

一个模型中，很重要的技巧就是要确定训练集与测试集特征是否同分布，这也是机器学习的一个很重要的假设，但很多时候我们默认这个道理，却很难有方法来保证数据同分布。

## T检验（Binary） ##

T检验是一种适合小样本的统计分析方法，通过比较不同数据的均值，研究两组数据是否存在差异。

我们参考《python科学计算第二版》：

https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin.qq.com/s/sv5QipNA6QPWgDC3R8DuAQ

### 单样本t检验 ###

单样本t检验是样本均值与总体均值的比较问题。其中总体服从正态分布，从正态总体中抽样得到n个个体组成抽样样本，计算抽样样本均值和标准差，判断总体均值与抽样样本均值是否相同。

from scipy.stats import ttest_1samp
    import numpy as np
    
    print("Null Hypothesis:μ=μ0=30，α=0.05")
    ages = [25,36,15,40,28,31,32,30,29,28,27,33,35]
    t = (np.mean(ages)-30)/(np.std(ages,ddof=1)/np.sqrt(len(ages)))
    
    ttest,pval = ttest_1samp(ages,30)
    print(t,ttest)
    if pval < 0.05:
    	print("Reject the Null Hypothesis.")
    else:
    	print("Accept the Null Hypothesis.")

### 配对样本t检验 ###

配对样本主要是同一实验前后效果的比较，或者同一样品用两种方法检验结果的比较。可以把配对样本的差作为变量，差值的总体均数为0，服从正态分布。

from scipy.stats import ttest_rel
    s1 = [620.16,866.50,641.22,812.91,738.96,899.38,760.78,694.95,749.92,793.94]
    s2 = [958.47,838.42,788.90,815.20,783.17,910.92,758.49,870.80,826.26,805.48]
    print("Null Hypothesis:mean(s1)=mean(s2)，α=0.05")
    ttest,pval = ttest_rel(s1,s2)
    if pval < 0.05:
    	print("Reject the Null Hypothesis.")
    else:
    	print("Accept the Null Hypothesis.")

### 独立样本t检验 ###

对于第三个问题独立样本t检验，比较两个样本所代表的两个总体均值是否存在显著差异。除了要求样本来自正态分布，还要求两个样本的总体方差相等“方差齐性”。

from scipy.stats import ttest_ind,norm,f
    import numpy as np
    def ftest(s1,s2):
    	'''F检验样本总体方差是否相等'''
    	print("Null Hypothesis:var(s1)=var(s2)，α=0.05")
    	F = np.var(s1)/np.var(s2)
    	v1 = len(s1) - 1
    	v2 = len(s2) - 1
    	p_val = 1 - 2*abs(0.5-f.cdf(F,v1,v2))
    	print(p_val)
    	if p_val < 0.05:
    		print("Reject the Null Hypothesis.")
    		equal_var=False
    	else:
    		print("Accept the Null Hypothesis.")
    	 	equal_var=True
    	return equal_var
    	 	
    def ttest_ind_fun(s1,s2):
    	'''t检验独立样本所代表的两个总体均值是否存在差异'''
    	equal_var = ftest(s1,s2)
    	print("Null Hypothesis:mean(s1)=mean(s2)，α=0.05")
    	ttest,pval = ttest_ind(s1,s2,equal_var=equal_var)
    	if pval < 0.05:
    		print("Reject the Null Hypothesis.")
    	else:
    		print("Accept the Null Hypothesis.")
    	return pval
    
    np.random.seed(42)
    s1 = norm.rvs(loc=1,scale=1.0,size=20)
    s2 = norm.rvs(loc=1.5,scale=0.5,size=20)
    s3 = norm.rvs(loc=1.5,scale=0.5,size=25)
    
    ttest_ind_fun(s1,s2)
    ttest_ind_fun(s2,s3)

## KS检验（Numerical） ##

KS检验是一种统计检验方法，其通过比较两样本的频率分布、或者一个样本的频率分布与特定理论分布（如正态分布）之间的差异大小来推论两个分布是否来自同一分布。

KS检验与t-检验之类的其他方法不同是KS检验不需要知道数据的分布情况，可以算是一种非参数检验方法。当然这样方便的代价就是当检验的数据分布符合特定的分布事，KS检验的灵敏度没有相应的检验来的高。在样本量比较小的时候，KS检验最为非参数检验在分析两组数据之间是否不同时相当常用。

PS：t-检验的假设是检验的数据满足正态分布，否则对于小样本不满足正态分布的数据用t-检验就会造成较大的偏差，虽然对于大样本不满足正态分布的数据而言t-检验还是相当精确有效的手段。

### 判断是否符合正态分布 ###

KS函数说明文档：https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.stats.kstest.html

import numpy as np
    import pandas as pd
    from scipy import stats
    
    data = [87,77,92,68,80,78,84,77,81,80,80,77,92,86,
           76,80,81,75,77,72,81,72,84,86,80,68,77,87,
           76,77,78,92,75,80,78]
    # 样本数据，35位健康男性在未进食之前的血糖浓度
    
    df = pd.DataFrame(data, columns =['value'])
    e = df['value'].mean()  # 计算均值
    std = df['value'].std()  # 计算标准差
    stats.kstest(df['value'], 'norm', (e, std))
    # .kstest方法：KS检验，参数分别是：待检验的数据，检验方法（这里设置成norm正态分布），均值与标准差
    # 结果返回两个值：statistic → D值，pvalue → P值
    # p值大于0.05，为正态分布
    
    #KstestResult(statistic=0.1590180704824098, pvalue=0.3066297258358026)
    # p值大于0.05，不拒绝原假设，因此上面的数据服从正态分布。
    #且一般情况下， stats.kstest(df[‘value’], ‘norm’, (u, std))一条语句就得到p值的结果。
    
    #from scipy import stats
    #stats.kstest(rvs, cdf, args=(),…)
    #其中rvs可以是数组、生成数组的函数或者scipy.stats里面理论分布的名字
    #cdf可以与rvs一致。若rvs和cdf同是数组，则是比较两数组的分布是否一致；一个是数组，另一个是理论分布的名字，则是看样本是否否和理论分布
    #args是一个元组，当rvs或者cds是理论分布时，这个参数用来存储理论分布的参数，如正态分布的mean和std。

## KL Divergence ##

KL 散度是一种衡量两个概率分布的匹配程度的指标，两个分布差异越大，KL散度越大。注意如果要查看测试集特征是否与训练集相同，P代表训练集，Q代表测试集，这个公式对于P和Q并不是对称的。

计算公式为:

对于离散分布

对于连续分布

import numpy as np
    import scipy.stats
    
    # 随机生成两个离散型分布
    x = [np.random.randint(1, 11) for i in range(10)]
    print(x)
    print(np.sum(x))
    px = x / np.sum(x)
    print(px)
    y = [np.random.randint(1, 11) for i in range(10)]
    print(y)
    print(np.sum(y))
    py = y / np.sum(y)
    print(py)
    
    # 利用scipy API进行计算
    # scipy计算函数可以处理非归一化情况，因此这里使用
    # scipy.stats.entropy(x, y)或scipy.stats.entropy(px, py)均可
    KL = scipy.stats.entropy(x, y) 
    print(KL)
    
    # 实现
    KL = 0.0
    for i in range(10):
        KL += px[i] * np.log(px[i] / py[i])
        # print(str(px[i]) + ' ' + str(py[i]) + ' ' + str(px[i] * np.log(px[i] / py[i])))
    
    print(KL)

## 机器学习模型检测 ##

用特征训练模型来分辨测试集与测试集，若模型效果好的话代表训练集和测试集存在较大差异，否则代表训练集和测试集分布比较相似。

具体做法是构建一个二分类模型，对训练集打上0，测试集打上1，然后shuffle一下进行训练，若分类效果好，代表训练集和测试集区分度很高，那么分布差异就较大。

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